Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sdc2P43407 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sdc2P43407 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sdc2P43407 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sdc2P43407 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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