Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VhlP40338 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms