Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms