Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms