Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms