Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms