Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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TbpP29037 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TbpP29037 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TbpP29037 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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