Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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