Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aco1P28271 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aco1P28271 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aco1P28271 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms