Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms