Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkchP23298 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkchP23298 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms