Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ntf3P20181 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms