Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VimP20152 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VimP20152 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VimP20152 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VimP20152 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms