Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms