Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NefhP19246 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms