Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sdc1P18828 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms