Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18528 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18528 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18528 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18528 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms