Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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