Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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