Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms