Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DmdP11531 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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DmdP11531 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DmdP11531 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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DmdP11531 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DmdP11531 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DmdP11531 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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DmdP11531 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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DmdP11531 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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DmdP11531 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DmdP11531 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms