Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms