Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms