Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col3a1P08121 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms