Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06334 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06334 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06334 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06334 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06334 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06334 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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