Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01641 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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P01641 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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P01641 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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P01641 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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P01641 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01641 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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P01641 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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P01641 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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P01641 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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P01641 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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