Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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