Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cops6O88545 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cops6O88545 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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