Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms