Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlkO54988 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlkO54988 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms