Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms