Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms