Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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