Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6bO35451 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms