Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnk3O35111 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnk3O35111 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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