Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif1cO35071 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms