Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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