Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms