Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms