Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms