Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MttpO08601 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MttpO08601 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MttpO08601 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MttpO08601 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms