Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms