Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20939L7N243 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20939L7N243 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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