Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lipo1J3QME6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms