Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem200cJ3QK46 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms