Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms