Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17535J3KMR8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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