Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp408H7BX78 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp408H7BX78 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms