Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pot1bH7BX60 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms