Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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